工伤期间公司仅发放基本工资，存在法律风险，以下为具体说明：
1. **经济损失风险**：长期仅发基本工资会大幅减少你停工留薪期收入，影响生活开支及医疗康复费用。例如，你受伤前月工资8000元（基本工资3000元+绩效5000元），若公司仅发3000元基本工资，每月损失5000元，6个月停工留薪期总计损失30000元。
2. **维权证据链风险**：若未及时保存工资条、银行流水（无法证明完整收入）或工伤认定决定书、医疗证明等关键材料，后续协商、投诉或仲裁时难以充分举证公司未足额支付工资及工伤事实，可能导致维权失败。例如，仅提供基本工资条无法证明绩效工资存在，公司可能以此拒绝支付差额。
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工伤期间公司仅发基本工资的处理，可能受特殊情形影响，具体如下：
1. **经营困难协商延期支付**：根据规定，用人单位因生产经营困难暂时无法按时支付工资的，经与工会或职工代表协商一致，可延期支付（最长不超过30日）。若公司确因困难协商延期支付工伤期间部分工资（含非基本工资部分）并在30日内补足，且有书面协商记录，此行为不视为违法克扣工资。
2. **停工留薪期未通过法定程序确认**：若公司与你对停工留薪期期限有争议，且你未向设区的市级劳动能力鉴定委员会申请确认，公司可能按较短期限支付工资或在期满后停发原待遇。此时需先通过法定程序确认停工留薪期，才能要求公司按规定支付工资。
3. **劳动合同有合法特殊约定**：若劳动合同明确约定工伤期间工资标准且不低于最低工资，同时不违反《工伤保险条例》“原工资福利待遇不变”的强制性规定（如约定按前12个月平均工资比例支付且不低于原待遇），则可按约定执行；若仅约定基本工资且低于原待遇，则约定因违法而无效。
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工伤期间公司仅发基本工资是否合法，可依据《工伤保险条例》判断。《工伤保险条例》第三十三条明确规定：“职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。”这里的“原工资福利待遇”包括基本工资、绩效工资、奖金、津贴等工伤前正常工资收入。若公司仅支付基本工资，未包含绩效等收入，则违反该条款“原工资福利待遇不变”的规定。因此，在停工留薪期已认定工伤的情况下，公司仅发基本工资的行为违法，你有权要求补足差额。
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处理工伤期间公司仅发基本工资问题时，需避免以下错误操作：
1. **未及时申请工伤认定**：部分职工误认为受伤即属工伤，忽略在事故发生之日起1年内申请工伤认定。超期可能导致无法认定工伤，进而无法享受停工留薪期原工资福利待遇。
2. **轻易签署不合理协议**：公司可能以“私了”为由要求签署放弃部分权益的协议（如仅支付基本工资），若你不了解权益盲目签署，后续难以主张应得工资差额。
3. **缺乏证据保存意识**：未妥善保存工伤认定决定书、工资条、医疗证明等关键材料，协商或维权时因举证不足可能影响结果。

若已出现上述问题或担心权益受损，可随时咨询我，我会为你提供专业解答和补救建议。

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